Depuis son engagement dans une politique volontariste de certification pour l'ensemble de ses titres il y a un an et demi, l'ECEMA a remporté son pari. En effet, avec la certification de trois nouveaux titres, la totalité des cycles proposés par l'école sont à présent certifiés.
En juillet 2011, le Ms 2 « Analyste Financier » bénéficie de la certification AMF (Autorité des Marchés Financiers).
En août 2011, le Ms 2 « Manager des Ressources Humaines » enregistré auprès du RNCP obtient la certification de Niveau I.
En avril 2012, l'ECEMA obtient également la certification de Niveau I pour deux de ses titres : les Ms 2 « Manager de Projet Transversal » et « Manager Environnemental ».
En août 2012, le titre « Manager des Organisations » (MDO) délivré par l'ECEMA LYON à l'issu du cycle PSM, est certifié par l'État Niveau I pour 5 ans.
Depuis le 8 octobre 2012, les cycles Ms 2 Communication, Commerce International et Marketing sont certifiés Niveau I par la CNCP, comme éléments spécialisés du management de projet.
L'obtention de l'ensemble de ces certifications représente une reconnaissance pour la qualité de l'enseignement proposé par l'ECEMA, mais aussi l'expertise, le niveau de compétence et l'évolution des anciens diplômés. En plein essor cette école Supérieure de Management par Alternance, peu désormais se féliciter d'être 100% certifiée.