A l'encontre des projets de la ministre de l'enseignement supérieur et de la recherche, Valérie Pécresse, les députés ont adopté un amendement de Claude Goasguen réservant la fonction de président d'université aux seuls enseignants-chercheurs.
L'opposition s'est mobilisée contre ce projet de loi en se prononçant contre les cinq premiers articles du texte et s'inquiète des « pouvoirs exorbitants » conférés aux présidents d'université et regrette que la réforme donne « de nouvelles missions sans donner de nouveaux moyens ».