
La Suisse pourra exercer son influence à différents niveaux. L'agence est certes une institution de l'Union européenne, mais elle dispose de son propre budget et est contrôlée par un conseil d'administration, au sein duquel l'Office fédéral de l'environnement (OFEV) disposera d'un siège. Son représentant pourra donner son avis mais n'aura pas le droit de vote.